成立背景：2008年，黨的十七屆三中全會明確提出，要創新農村金融體制，拓寬融資渠道，引導更多信貸和社會資金投向農村。2010年中央1號文件提出，要提高農村金融服務質量和水平，建立農業產業發展基金。
為貫徹落實2010年中央1號文件的要求，財政部于2011年5月向國務院上報了《財政部關于設立中國農業產業發展基金的請示》。2012年12月，國務院批復，同意財政部聯合中國農業發展銀行、中國信達資產管理股份有限公司、中國中信集團有限公司三家金融機構發起設立中國農業產業發展基金。2012年12月18日，基金正式成立。
2012年12月，國務院批復同意基金成立，并明確了基金的名稱、目標、定位、資金規模、投資策略和管理方式，要求基金采取有限責任公司形式，按照現代企業制度規范，獨立經營，自負盈虧。
截止2020年底，基金投資了21家農業龍頭企業并積極引導社會資本跟投，帶動了企業、行業、產業、地方和區域的發展，為群眾脫貧致富作出了積極貢獻。